1

发表期刊：Mol Cancer

影响因子：27.7

发表时间：2024年10月21日

背景：癌症患者更容易受到COVID-19侵袭性病程的影响。开发识别COVID-19相关死亡高风险癌症患者的生物标志物可能有助于确定哪些人需要早期临床干预。位于与侵袭性COVID-19风险相关的基因组区域中的miRNAs可能代表临床预后的潜在生物标志物。

结果：研究发现miRNAs在CORSAIR（COVID-19 risk-associated genomic regions）中富集。低血浆水平的hsa-miR-150-5p和hsa-miR-93-5p与较高的COVID-19相关死亡率相关。hsa-miR-92b-3p水平与SARS-CoV-2检测阳性相关。外周血单核细胞（PBMC）在体外TLR7/8和T细胞受体（TCR）介导激活后增加了hsa-miR-150-5p、hsa-miR-93-5p和hsa-miR-92b-3p的分泌。在接种第二剂辉瑞-BioNTech COVID-19疫苗后1至9个月期间，在健康个体的血清样本中测量了这三种miRNA水平的增加。人气道上皮细胞的SARS-CoV-2感染影响了其分泌的细胞外囊泡内的miRNA水平。

结论：MiRNAs在 CORSAIR中富集。血浆miRNA水平可以代表预测癌症患者COVID-19相关死亡的潜在血液生物标志物。

2

发表期刊：Nat Commun

影响因子：14.7

发表时间：2024年10月23日

MicroRNAs（miRNAs）与人类疾病有关，从癌症到传染病。用小分子靶向miRNAs或其靶基因为调节与疾病相关的失调细胞过程提供了机会。然而，由于小分子-miRNA数据集的规模较小，预测与miRNAs相关的小分子仍然具有挑战性。本研究开发了一个通用深度学习框架sChemNET，用于根据化学结构和序列信息预测影响miRNA生物活性的小分子。sChemNET通过一个目标函数克服了化学信息稀疏的限制，该目标函数允许神经网络从大量未知的影响miRNAs化学结构中学习化学空间。研究人员通过实验验证了预测的作用于miR-451或其靶标的小分子，并测试了它们在斑马鱼胚胎发生过程中红细胞成熟中的作用。还使用体外和体内实验测试了靶向miR-181网络和其他miRNAs的小分子。本研究证明，该机器学习框架可以预测在人类和其他哺乳动物生物体中靶向miRNAs或其靶标的生物活性小分子。

3

发表期刊：Blood Cancer J

影响因子：12.9

发表时间：2024年10月23日

慢性淋巴细胞白血病（CLL）的发生和发展取决于遗传异常和免疫抑制微环境。研究人员已经探索了遗传驱动因素可能导致塑造促肿瘤微环境的免疫细胞失调的可能性。本研究在基于Rag2-/-γc-/-MEC1的异种移植模型中对白血病进展过程中的编码和非编码RNAs（ncRNAs）进行了转录组分析。DLEU2/miR-16位点在白血病小鼠的单核细胞/巨噬细胞中被发现下调。为了验证该簇在肿瘤免疫微环境中的作用，研究人员生成了一个小鼠模型，该模型同时模拟hTCL1的过表达和编码DLEU2/miR-15a/miR-16-1簇的最小缺失区（MDR）的种系缺失。该模型提供了一种创新且更快的CLL系统，其中单核细胞分化和巨噬细胞极化加剧，T细胞功能失调。MDR缺失与小鼠CLL细胞和免疫细胞上预测的靶蛋白（包括BCL2和PD1/PD-L1）的水平呈负相关。miR-15a/miR-16-1与靶蛋白的负相关已在患者来源的免疫细胞上得到证实。miR-16-1的强制表达干扰单核细胞分化为肿瘤相关巨噬细胞，表明选定的ncRNAs驱动非恶性免疫细胞的促肿瘤表型。

4

发表期刊：J Nanobiotechnology

影响因子：10.6

发表时间：2024年10月26日

背景：凋亡囊泡（ApoVs）是由凋亡细胞释放的细胞外囊泡，据报道对炎症性疾病和组织再生具有巨大的治疗潜力。虽然对间充质干细胞（MSCs）进行了广泛的研究，但对免疫细胞来源的ApoVs的研究仍然有限，特别是关于巨噬细胞来源的ApoVs在牙周炎（PD）中的功能和命运。

结果：本研究证实了牙龈卟啉单胞菌（Pg）相关PD中巨噬细胞凋亡的发生及其作用。这些发现揭示了凋亡巨噬细胞及其衍生的ApoVs在协调牙周骨重塑中发挥的关键作用。通过测序技术可以鉴定这些ApoVs中不同功能性miRNAs的富集。此外，本研究阐明了巨噬细胞来源的ApoVs主要递送miR-143-3p，靶向胰岛素样生长因子结合蛋白5（IGFBP5），从而破坏牙周骨稳态。

结论：本研究揭示了Pg相关PD中的巨噬细胞发生细胞凋亡并产生富含miR-143-3p的ApoVs以沉默IGFBP5，导致成骨-破骨细胞平衡的扰动和随之而来的牙周骨破坏。因此，针对巨噬细胞中miR-143-3p的干预措施或采用细胞凋亡抑制剂Z-VAD有望成为管理PD的有效治疗策略。

5

发表期刊：Genome Biol

影响因子：10.1

发表时间：2024年10月21日

背景：MicroRNAs（miRNAs）是一种转录后调节基因表达的小非编码RNAs。已知血浆miRNA水平的扰动会影响疾病风险，并有可能成为疾病生物标志物。探索miRNAs的遗传调控可能会对它们在控制基因表达和疾病机制中的重要作用产生新的见解。

结果：本研究对参与鹿特丹研究的2178名参与者中的2083个血浆循环miRNAs进行了全基因组关联研究，以确定miRNA表达数量性状位点（miR-eQTLs）。结果确定了1289个SNPs和63个miRNAs之间的3292个关联，其中65%在两个独立的队列中被复制。本研究证明血浆miR-eQTLs与基因表达、蛋白质和代谢物QTL共定位，这有助于识别miRNA调节的通路。研究人员使用UK Biobank数据（N=423,419）在全表型组关联研究和孟德尔随机化研究中调查了循环miRNA水平改变对各种临床条件的影响，揭示了几种miRNAs对各种临床状况的多效性和因果效应。在孟德尔随机化分析中，研究人员发现miR-1908-5p对良性结肠肿瘤风险的保护性因果效应，并表明这种效应与其宿主基因（FADS1）无关。

结论：本研究丰富了我们对血浆miRNAs遗传结构的理解，并探讨了miRNAs在各种临床条件下的特征。基于群体的基因组学、其他组学层和临床数据的整合为揭示miRNAs的潜在临床意义提供了机会，并为基于miRNA的新型治疗靶点发现提供了工具。